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眼見為實:視頻原子力顯微鏡顯示實時CRISPR基因編輯

更新時間:2018-01-09點擊次數(shù):872

    自2012年以來,研究人員常用種叫做CRISPR的強大“基因組編輯”技術對生物的DNA序列進行修剪、切斷、替換或添加。CRISPR來自微生物的免疫系統(tǒng),這種工程編輯系統(tǒng)用種酶,能把段作為引導工具的小RNA切入DNA,就能在此處切斷或做其他改變。

    CRISPR已經(jīng)成為生命科學域zui受關注的基因編輯技術,其效果得到大家致認可。雖然科學家可通過RT-PCR、WB等方法間接證明CRISPR的功能,但仍未有直接的證據(jù)來證實。究其原因:是生物分子間的相互作用速率快,需要高速的成像手段才能捕捉到;二是生物分子比較小,通常為納米,普通顯微鏡由于受光學衍射限所限不能分辨。zui近,日本Kanazawa University的科學家用 視頻原子力顯微鏡HS-AFM 成功觀察到了實時CRISPR基因編輯,為CRISPR技術的有效性提供了直接的證據(jù)。
 
HS-AFM視頻結果直觀顯示構象差異

 

    HS-AFM視頻結果顯示apo-Cas9為柔性構象(flexible conformations),而Cas9–RNA則為穩(wěn)定的雙葉型構象(stable bilobed architecture)。 

 
Cas9-RNA介導的PAM依賴性DNA識別

 

 
Cas9-RNA靶向定位到目的DNA,形成Cas9–RNA–DNA復合體。

 

Cas9-RNA對目的DNA進行剪切  

 

 

在Mg2+存在的條件下,Cas9-RNA對目的DNA進行異性剪切。

    這項工作的完成主要借助了日本RIBM公司研發(fā)的超高速視頻原子力顯微鏡HS-AFM,HS-AFM突破了傳統(tǒng)原子力顯微鏡“掃描成像速慢”的限制,能夠實現(xiàn)在液體環(huán)境下超快速動態(tài)成像,分辨率為納米水平。待測樣品無需殊固定,不影響生物分子的活性,尤其適用于生物大分子互作動態(tài)觀測。推出至今,已有80多位用戶,發(fā)表SCI論文200余篇,其中包括Science, Nature, Cell 等*雜志。 
 
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